RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552268.5

APAF1-211, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1-211ENST00000552268 CR2P20023 1033 aa6.66□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 WASP42768 502 aa6.66□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 RGRP47804 291 aa6.66□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 COPAP53621 1224 aa6.66□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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APAF1-211ENST00000552268 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 23
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APAF1-211ENST00000552268 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.65□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.65□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 IER2Q9BTL4 223 aa6.65□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.65□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.65□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.65□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APAF1-211ENST00000552268 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.65□□□□□ -1.34
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