RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 POLE4Q9NR33 117 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SNTG2Q9NY99 539 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MICAL2O94851 1124 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NFICP08651 508 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 IFNL1Q8IU54 200 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PJA1Q8NG27 643 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MCFD2Q8NI22 146 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC120Q96HB5 630 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FAM84AQ96KN4 292 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 APBA2Q99767 749 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SIX4Q9UIU6 781 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HACD1B0YJ81 288 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TBX1O43435 398 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ERCC2P18074 760 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KCNA5P22460 613 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TAF6P49848 677 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FSTL1Q12841 308 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 DLG1Q12959 904 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00523Q86TU6 105 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 OR8K3Q8NH51 312 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FZD1Q9UP38 647 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 A8MU76 341 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 GPR25O00155 361 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 AURKAO14965 403 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KMOO15229 486 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ALOX15BO15296 676 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ZW10O43264 779 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PLOD3O60568 738 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KDM4BO94953 1096 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 C8BP07358 591 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MYL3P08590 195 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KDELR1P24390 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ALDH4A1P30038 563 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TAS2R40P59535 323 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SREBF2Q12772 1141 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 IL31Q6EBC2 164 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SPOCK2Q92563 424 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CDH9Q9ULB4 789 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 DFFAO00273 331 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 IVDP26440 423 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NR4A2P43354 598 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PSEN2P49810 448 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A3Q01959 620 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 GTF2H3Q13889 308 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MFSD10Q14728 455 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 XKR4Q5GH76 650 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MORN1Q5T089 497 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MARK4Q96L34 752 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms