RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SETD4Q9NVD3 440 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL17BQ9UHF5 180 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF711Q9Y462 761 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCL27Q9Y4X3 112 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 A8MXE2 369 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 VWA5AO00534 786 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAP2K7O14733 419 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 OGG1O15527 345 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AVILO75366 819 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPC4O75487 556 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAGE7O76087 117 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TPPPO94811 219 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 QDPRP09417 244 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAGE12FP0CL80 117 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAGE12GP0CL81 117 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAGE12IP0CL82 117 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MPGP29372 298 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ME1P48163 572 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MMP14P50281 582 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSEP51690 589 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPR143P51810 404 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GALCP54803 685 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 INHBEP58166 350 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAGE1Q13065 139 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAGE4Q13068 117 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CAPSQ13938 189 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MANEAQ5SRI9 462 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LCN10Q6JVE6 187 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CES5AQ6NT32 575 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MON1BQ7L1V2 547 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AADATQ8N5Z0 425 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRIB2Q92519 343 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LPAR1Q92633 364 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRFN5Q96NI6 719 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AP1M1Q9BXS5 423 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LHPPQ9H008 270 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MMP27Q9H306 513 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HRH4Q9H3N8 390 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GDE1Q9NZC3 331 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PADI1Q9ULC6 663 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LNP1A1A4G5 178 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 IFNL4K9M1U5 179 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LDB2O43679 373 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MOSPD3O75425 235 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 RGS11O94810 467 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 VNN2O95498 520 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CBSLP0DN79 551 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 RRM1P23921 792 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CBSP35520 551 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LIG4P49917 911 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 RAD23AP54725 363 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SORDQ00796 357 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ROR1Q01973 937 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SREBF2Q12772 1141 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GRAPQ13588 217 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCNC3Q14003 757 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 COLEC12Q5KU26 742 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KBTBD6Q86V97 674 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms