RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ACCSLQ4AC99 568 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 RRM2BQ7LG56 351 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 UCMAQ8WVF2 138 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SKA1Q96BD8 255 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 BBS4Q96RK4 519 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 EBF2Q9HAK2 575 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ABI3Q9P2A4 366 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PNMA2Q9UL42 364 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.49□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 FAM172BPA6NC97 362 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CRYAAP02489 173 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 TFPIP10646 304 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ETFAP13804 333 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 GM2AP17900 193 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 MAN1A1P33908 653 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF132P52740 706 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 NLRP5P59047 1200 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 RUNX2Q13950 521 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 FGFBP1Q14512 234 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 VEPH1Q14D04 833 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PPP2R5BQ15173 497 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CDC73Q6P1J9 531 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 LCTLQ6UWM7 567 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PXKQ7Z7A4 578 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 OTULINQ96BN8 352 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 WDFY2Q96P53 400 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ITPAQ9BY32 194 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PSAT1Q9Y617 370 aa3.48□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 A0A087X0M5 115 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 A0A1B0GX30 115 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CPED1A4D0V7 1026 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SEC14L5O43304 696 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PAGE4O60829 102 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 BAIAP3O94812 1187 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 KDM4BO94953 1096 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CLDN14O95500 239 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 MLYCDO95822 493 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CYC1P08574 325 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 KCNA5P22460 613 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 GNAQP50148 359 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 ARHGEF6Q15052 776 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 EFNB3Q15768 340 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 MMEL1Q495T6 779 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 FAAH2Q6GMR7 532 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 MTSS1LQ765P7 747 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SHFQ7M4L6 423 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 LRRC8CQ8TDW0 803 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 FBXO17Q96EF6 278 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SAAL1Q96ER3 474 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 DUX3Q96PT4 197 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 VDAC3Q9Y277 283 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFCD-210ENST00000490205 P2RY10O00398 339 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms