RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CNGA4Q8IV77 575 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM71BQ8TC56 605 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 POM121Q96HA1 1249 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC42Q96M95 316 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PSKH2Q96QS6 385 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ESPL1Q14674 2120 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 H3BM21 787 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 K7ESM1 405 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TOR1BO14657 336 aa6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 CD48P09326 243 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ITIH2P19823 946 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NR1D1P20393 614 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 IL4RP24394 825 aa6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 ARSEP51690 589 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 POLE2P56282 527 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TAS2R40P59535 323 aa6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 BBS5Q8N3I7 341 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ARL14Q8N4G2 192 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PAF1Q8N7H5 531 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM5Q9C035 493 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ABCG4Q9H172 646 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.45□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PQ67 120 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CPED1A4D0V7 1026 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CFAP69A5D8W1 941 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NEMP2A6NFY4 417 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MFSD11O43934 449 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SOCS5O75159 536 aa6.44□□□□□ -1.38
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