RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481605.5

TTC3-217, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 1,540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-217ENST00000481605 D6RAR5 112 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CBFA2T2O43439 604 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CEACAM5P06731 702 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 KRT10P13645 584 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CERCAMQ5T4B2 595 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ARL14Q8N4G2 192 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 PQLC3Q8N755 202 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 KCNE4Q8WWG9 221 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SMIM14Q96QK8 99 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 LRRN3Q9H3W5 708 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 FUCA1P04066 466 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TMEM253P0C7T8 217 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CCNB1P14635 433 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 MAN1A1P33908 653 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 EPHB1P54762 984 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CXADRP78310 365 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 GBE1Q04446 702 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 IHHQ14623 411 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 LRRC66Q68CR7 880 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CCNJLQ8IV13 435 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 FATE1Q969F0 183 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 FOXP3Q9BZS1 431 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CD84Q9UIB8 345 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 APPL1Q9UKG1 709 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 A0A0J9YYE9 177 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 AKR1B10O60218 316 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TNFSF15O95150 251 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TRBC1P01850 177 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CES1P23141 567 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 GNPDA1P46926 289 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 DPTQ07507 201 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.341e-7■□□□□ 11.2
TTC3-217ENST00000481605 MESDQ14696 234 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 BROXQ5VW32 411 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 GPR155Q7Z3F1 870 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 GPBAR1Q8TDU6 330 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 RAPGEF5Q92565 580 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 LRIT1Q9P2V4 623 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 AMACRQ9UHK6 382 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SUFUQ9UMX1 484 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CHKBQ9Y259 395 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 KLK10O43240 276 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 MX2P20592 715 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TEAD1P28347 426 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 GPR1P46091 355 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 PTSQ03393 145 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 NRROSQ86YC3 692 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CCNYQ8ND76 341 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 GSDMCQ9BYG8 508 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 DPH1Q9BZG8 443 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 DTLQ9NZJ0 730 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ATRXP46100 2492 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 HLA-DQB2P05538 268 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 PNLIPP16233 465 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ZNF30P17039 623 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 KDELR1P24390 212 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 POLD2P49005 469 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 INHBCP55103 352 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 AP2M1Q96CW1 435 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 HDAC11Q96DB2 347 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 RNF157Q96PX1 679 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 CHP1Q99653 195 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 STRADBQ9C0K7 418 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ABCG8Q9H221 673 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 KIF26BQ2KJY2 2108 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 PLD2O14939 933 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 SOD1P00441 154 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 ITGA2BP08514 1039 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC3-217ENST00000481605 TPM1P09493 284 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms