RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 ARNT2Q9HBZ2 717 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 ECEL1O95672 775 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 PCCBP05166 539 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 BASP1P80723 227 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 KIF19Q2TAC6 998 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 Q6ZSR6 202 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 KIAA2013Q8IYS2 634 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 GDF3Q9NR23 364 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 SPO11Q9Y5K1 396 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 KNL1Q8NG31 2342 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 RGSL1A5PLK6 1076 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 CER1O95813 267 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 SLC4A1P02730 911 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 CTSKP43235 329 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 NXPH1P58417 271 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 PFN3P60673 137 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 YPEL5P62699 121 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 BNC1Q01954 994 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF765Q7L2R6 523 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 TMC3Q7Z5M5 1100 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 SNX11Q9Y5W9 270 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-208ENST00000476342 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 APRTP07741 180 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 SPINT3P49223 89 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 DPTQ07507 201 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 INPP5AQ14642 412 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 RAD18Q9NS91 495 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PCYOX1Q9UHG3 505 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 CD84Q9UIB8 345 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TMEM131Q92545 1883 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 SUN1O94901 812 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TSHRP16473 764 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 HMGCLP35914 325 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 THOP1P52888 689 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PPP1R7Q15435 360 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 DENND5AQ6IQ26 1287 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF592Q92610 1267 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 AP2M1Q96CW1 435 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 CDH19Q9H159 772 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PYGLP06737 847 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 VPS41P49754 854 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 GPS1Q13098 491 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PTK2BQ14289 1009 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 RAET1GQ6H3X3 334 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PNCKQ6P2M8 343 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 NLRP8Q86W28 1048 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 OXR1Q8N573 874 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 MINDY1Q8N5J2 469 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PLA2G15Q8NCC3 412 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 SLCO2A1Q92959 643 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 EID2BQ96D98 161 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 ABCG8Q9H221 673 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 GAREM1Q9H706 876 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TMEM9BQ9NQ34 198 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 GPR27Q9NS67 375 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 RXFP3Q9NSD7 469 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 AURKAO14965 403 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 DFNA5O60443 496 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 CDH17Q12864 832 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 HLA-BQ31612 363 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 RFLNAQ6ZTI6 216 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 KLHL7Q8IXQ5 586 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 DNAAF3Q8N9W5 541 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 BRSK1Q8TDC3 778 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 APOOQ9BUR5 198 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 FAM83DQ9H4H8 585 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 NEU2Q9Y3R4 380 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 SCN8AQ9UQD0 1980 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 C2orf81A6NN90 581 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TEAD1P28347 426 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TTC30BQ8N4P2 665 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 SCAMP4Q969E2 229 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 WDR26Q9H7D7 661 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PKP3Q9Y446 797 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 URI1O94763 535 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 CRTAMO95727 393 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 HTR1BP28222 390 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TRIM23P36406 574 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 GPR1P46091 355 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 DCDC1P59894 354 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 ARHGAP8P85298 464 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 PDE1BQ01064 536 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF423Q2M1K9 1284 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 KDM7AQ6ZMT4 941 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 OR52K1Q8NGK4 314 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-208ENST00000476342 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms