RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SPAM1P38567 509 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NUBP1P53384 320 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DCDC1P59894 354 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAMEP78395 509 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMG2Q02383 582 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CREB5Q02930 508 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ACVR1Q04771 509 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYMQ14894 314 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 KYNUQ16719 465 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LONRF1Q17RB8 773 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 STEAP4Q687X5 459 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CYS1Q717R9 158 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf74Q86VG3 221 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM69Q86WT6 500 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 HORMAD1Q86X24 394 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CALML6Q8TD86 181 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ASB12Q8WXK4 309 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 EID2BQ96D98 161 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD3Q96ES6 412 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 COQ10AQ96MF6 247 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GGT7Q9UJ14 662 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 KCTD3Q9Y597 815 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0U1RQS6 177 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PQU0 124 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC78A2IDD5 438 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR23AA6NEV1 266 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLON5A6NGN9 336 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 VAPBO95292 243 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PYGLP06737 847 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD2P08910 425 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 BPIP17213 487 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 STX2P32856 288 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSL1P33121 698 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ETV3P41162 512 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CCR5P51681 352 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TMPRSS15P98073 1019 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 AGERQ15109 404 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF284Q2VY69 593 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CES3Q6UWW8 571 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZVL8 140 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP8Q86W28 1048 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LONP2Q86WA8 852 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MREGQ8N565 214 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 RLN3Q8WXF3 142 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKL2Q92772 493 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 HDAC10Q969S8 669 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NUS1Q96E22 293 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DTD2Q96FN9 168 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SGSM3Q96HU1 749 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TBATAQ96M53 351 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF778Q96MU6 729 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms