RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 CTPS1P17812 591 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TEAD1P28347 426 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 INHBCP55103 352 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CDK3Q00526 305 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ITKQ08881 620 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 RAET1GQ6H3X3 334 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 Q6ZVL8 140 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TSPAN33Q86UF1 283 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 KCTD6Q8NC69 237 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM74Q96NL1 305 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 FOXP3Q9BZS1 431 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PPIL1Q9Y3C6 166 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CCKBRP32239 447 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PDK2Q15119 407 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 SPRED1Q7Z699 444 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 SFTPA2Q8IWL1 248 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PIH1D2Q8WWB5 315 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 MAML1Q92585 1016 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CPNE5Q9HCH3 593 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF215Q9Y6U7 377 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 COL6A6A6NMZ7 2263 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 FZD6O60353 706 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CEACAM5P06731 702 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PDHA1P08559 390 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 KRT7P08729 469 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CCNB1P14635 433 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PTPRRQ15256 657 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC66Q68CR7 880 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ALG1LQ6GMV1 187 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 RAB11FIP2Q7L804 512 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CPNE8Q86YQ8 564 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 MAP7D3Q8IWC1 876 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 FATE1Q969F0 183 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 LRIT1Q9P2V4 623 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TTLL3Q9Y4R7 772 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 MATN3O15232 486 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 MAP3K6O95382 1288 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 H2AFZP0C0S5 128 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CES1P23141 567 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 GNPDA1P46926 289 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 DPTQ07507 201 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC18A3Q16572 532 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 H2AFVQ71UI9 128 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 AMACRQ9UHK6 382 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 SUFUQ9UMX1 484 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 A0A0J9YYE9 177 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TRBC1P01850 177 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PRB1P04280 392 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF30P17039 623 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PTMSP20962 102 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CA4P22748 312 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CCNCP24863 283 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 UGT1A5P35504 534 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 GPR1P46091 355 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 EPHB1P54762 984 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TAS2R40P59535 323 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 DSC2Q02487 901 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 FAF2Q96CS3 445 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TSGA13Q96PP4 275 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 PACSIN1Q9BY11 444 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CD84Q9UIB8 345 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 DNPEPQ9ULA0 475 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 CFAP46Q8IYW2 2715 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 ERVH48-1M5A8F1 160 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 IVLP07476 585 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 MX2P20592 715 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 MAN1A1P33908 653 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-203ENST00000439830 RHDQ02161 417 aa25.15■■□□□ 1.62
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