RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 OPA1O60313 960 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TGM2P21980 687 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 MARCKSL1P49006 195 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ADCY2Q08462 1091 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 NR0B2Q15466 257 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CDKN3Q16667 212 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 KAZNQ674X7 775 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP8Q86W28 1048 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 EXD1Q8NHP7 514 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 MDM1Q8TC05 714 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 IFI44Q8TCB0 444 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 GLMNQ92990 594 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP41Q9BYV8 373 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT37O76014 449 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 RPIAP49247 311 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 STC1P52823 247 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 LLGL1Q15334 1064 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TEX44Q53QW1 395 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 GUSBP11Q6P575 273 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 GKN2Q86XP6 184 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT35Q92764 455 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 AGAP3Q96P47 875 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCG8Q9H221 673 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CPED1A4D0V7 1026 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PJA2O43164 708 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 MT-CO3P00414 261 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC25BP30305 580 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 VAV2P52735 878 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK3Q00526 305 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 QPCTQ16769 361 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM139Q8IV31 216 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TADA1Q96BN2 335 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 AP2M1Q96CW1 435 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PRSS38A1L453 326 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CLDN7O95471 211 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP4F3Q08477 520 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TCEA2Q15560 299 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC14A2Q15849 920 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R5EQ16537 467 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 P3H4Q92791 437 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 NAT6Q93015 286 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SCAMP4Q969E2 229 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TEKT5Q96M29 485 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIB3Q96RU7 358 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CD84Q9UIB8 345 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CHD6Q8TD26 2715 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SOD1P00441 154 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CEACAM5P06731 702 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PYGLP06737 847 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPN3P26045 913 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR1P46091 355 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 COPS2P61201 443 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms