RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 A8MU76 341 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DFFAO00273 331 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PRKAR1AP10644 381 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 THRAP10827 490 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CR2P20023 1033 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TNFAIP3P21580 790 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ETV3P41162 512 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CASRP41180 1078 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GPR3P46089 330 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CDK3Q00526 305 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DNAJC24Q6P3W2 148 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CLEC18BQ6UXF7 455 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 Q6ZVL8 140 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 FAM129CQ86XR2 697 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 BMPERQ8N8U9 685 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CTRCQ99895 268 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CNPY3Q9BT09 278 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DDA1Q9BW61 102 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SPRY4Q9C004 299 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PILRAQ9UKJ1 303 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PLAAQ9Y263 795 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGA6CA6NDK9 693 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGA6BA6NDN3 693 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CALB1P05937 261 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGA6DP0CG33 693 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GP1BBP13224 206 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ERCC2P18074 760 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 LHCGRP22888 699 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 AIF1P55008 147 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 BIRC2Q13490 618 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SQSTM1Q13501 440 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SNAP47Q5SQN1 464 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DOK6Q6PKX4 331 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TSPAN33Q86UF1 283 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 NRSN1Q8IZ57 195 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PGBD5Q8N414 524 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 RNF31Q96EP0 1072 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SMIM14Q96QK8 99 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PEBP4Q96S96 227 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SP110Q9HB58 689 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PCSK1NQ9UHG2 260 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 AP4E1Q9UPM8 1137 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SIK3Q9Y2K2 1263 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 B4E171 279 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 EML2O95834 649 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 OAS2P29728 719 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 VIPR1P32241 457 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TSPAN7P41732 249 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ACTR1BP42025 376 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ACTR1AP61163 376 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 IL10RBQ08334 325 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 NCAPHQ15003 741 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 KRT31Q15323 416 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 RAET1GQ6H3X3 334 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM71Q6P5X7 295 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM74Q86UV6 250 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 RTP4Q96DX8 246 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 DTD2Q96FN9 168 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ABHD17AQ96GS6 310 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 CLSTN2Q9H4D0 955 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 NOD2Q9HC29 1040 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 APMAPQ9HDC9 416 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 TAS2R14Q9NYV8 317 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 PDP2Q9P2J9 529 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 ANAPC2Q9UJX6 822 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-203ENST00000372906 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms