RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 TGFBIQ15582 683 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NRF1Q16656 503 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ANO4Q32M45 955 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SV2CQ496J9 727 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 IL23RQ5VWK5 629 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NPNTQ6UXI9 565 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DHFR2Q86XF0 187 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 EMC1Q8N766 993 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RNF149Q8NC42 400 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf38Q8TB03 319 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.253e-9■■■■■ 78.5
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OR52B2Q96RD2 323 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM19Q9H013 955 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HMG20AQ9NP66 347 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BFARQ9NZS9 450 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 WDR27A2RRH5 827 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CDC14CA4D256 554 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 G3V2L1 256 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 H3BMQ9 156 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 M0QYV0 167 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEB3O15480 346 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MTSS1O43312 755 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 METTL18O95568 372 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NTRK1P04629 796 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GPIP06744 558 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2F1P24903 491 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ARL4AP40617 200 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GPD2P43304 727 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN9P43378 593 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 STT3AP46977 705 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GLUD2P49448 558 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NDST2P52849 883 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 OCA2Q04671 838 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF846Q147U1 533 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PDK1Q15118 436 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DCLK2Q8N568 766 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PQLC3Q8N755 202 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf31Q8N865 590 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FAM47BQ8NA70 645 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T3Q8NH03 318 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 URGCPQ8TCY9 931 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 COG8Q96MW5 612 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RMI1Q9H9A7 625 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM165Q9HC07 324 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GMIPQ9P107 970 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AKT3Q9Y243 479 aa7.21□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf72A4D263 438 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01387J3KSC0 135 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ACKR2O00590 384 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM24O15164 1050 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NCAM2O15394 837 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP10O43572 662 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KATNA1O75449 491 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms