RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 MCFD2Q8NI22 146 aa16.06■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 CSH1P0DML2 217 aa16.04■□□□□ 0.16
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