RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 SLC47A2Q86VL8 602 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 KAT5Q92993 513 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 C5orf60A6NFR6 353 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 CEP76Q8TAP6 659 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 NFKBIZQ9BYH8 718 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 CD72P21854 359 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 ELOVL4Q9GZR5 314 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 AZIN1O14977 448 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 ZPBP2Q6X784 338 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF410Q86VK4 478 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
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PTPRB-202ENST00000334414 AGLP35573 1532 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 F5H6K3 240 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 KLF11O14901 512 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 MID1O15344 667 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 FGBP02675 491 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 SLC7A1P30825 629 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 KLRC3Q07444 240 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 SLC13A2Q13183 592 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-202ENST00000334414 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
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