RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 DLX3O60479 287 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 AQP4P55087 323 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 COG4Q9H9E3 785 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PGM3O95394 542 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CLPTM1O96005 669 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LAG3P18627 525 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CLCN2P51788 898 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LRRC36Q1X8D7 754 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CHST9Q7L1S5 443 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LTBP2Q14767 1821 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PEX1O43933 1283 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 NDST3O95803 873 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 EPOP01588 193 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SMIM18P0DKX4 95 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CDK4P11802 303 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DNAJB1P25685 340 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RFC2P35250 354 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 EPHB3P54753 998 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LPCAT4Q643R3 524 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LINGO4Q6UY18 593 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 JADE3Q92613 823 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RMDN1Q96DB5 314 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TRIB3Q96RU7 358 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DRC3Q9H069 523 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.48■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 INSIG1O15503 277 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 S1PR4O95977 384 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ACRP10323 421 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ICA1LQ8NDH6 482 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 A0A088AWK7 358 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ARHGAP10A1A4S6 786 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PIGNO95427 931 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 GLP2RO95838 553 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 C1RP00736 705 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SLC4A1P02730 911 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CBX3Q13185 183 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CYTH1Q15438 398 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TXNDC8Q6A555 127 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TMC7Q7Z402 723 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MAPK15Q8TD08 544 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PYDC1Q8WXC3 89 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 BHMTQ93088 406 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PLK2Q9NYY3 685 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DMTF1Q9Y222 760 aa21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TXNDC9O14530 226 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TEX28O15482 410 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SNAP91O60641 907 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TBL1XO60907 577 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CDKN2DP55273 166 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TMED1Q13445 227 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SMIM14Q96QK8 99 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 VWA7Q9Y334 891 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms