RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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RABGGTA-216ENST00000560243 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-216ENST00000560243 FGF22Q9HCT0 170 aa11.66□□□□□ -0.54
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RABGGTA-216ENST00000560243 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-216ENST00000560243 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-216ENST00000560243 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-216ENST00000560243 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.65□□□□□ -0.54
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RABGGTA-216ENST00000560243 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
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RABGGTA-216ENST00000560243 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-216ENST00000560243 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.65□□□□□ -0.54
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RABGGTA-216ENST00000560243 CD84Q9UIB8 345 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-216ENST00000560243 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTA-216ENST00000560243 FUCA1P04066 466 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 HTR1BP28222 390 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 VAV2P52735 878 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTA-216ENST00000560243 KIAA1024LP59773 190 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 PTSQ03393 145 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 WASHC5Q12768 1159 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 CAMK2BQ13554 666 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 ARHGEF7Q14155 803 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 TFDP2Q14188 446 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 GALNT3Q14435 633 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 CDKN3Q16667 212 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTA-216ENST00000560243 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTA-216ENST00000560243 SLC35F3Q8IY50 421 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTA-216ENST00000560243 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 OR56A4Q8NGH8 313 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTA-216ENST00000560243 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 SCAMP4Q969E2 229 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 ABCG8Q9H221 673 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-216ENST00000560243 WDR26Q9H7D7 661 aa11.64□□□□□ -0.55
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