RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 AP1B1Q10567 949 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC39A7Q92504 469 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HES6Q96HZ4 224 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BMFQ96LC9 184 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP41Q9BYV8 373 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 KALRNO60229 2985 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 POM121BA6NF01 834 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 A6NNZ2 444 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PIAS2O75928 621 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PGLSO95336 258 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PDHA1P08559 390 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 GM2AP17900 193 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ELP6Q0PNE2 266 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 OR13H1Q8NG92 308 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CENPTQ96BT3 561 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HAUS1Q96CS2 278 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR27Q9NS67 375 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BPTFQ12830 3046 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MYLKQ15746 1914 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SCAMP1O15126 338 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 FFAR2O15552 330 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT86O43790 486 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PRLP01236 227 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC175P0C221 793 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 LIG3P49916 1009 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 WASHC5Q12768 1159 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPRRQ15256 657 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CFAP58Q5T655 872 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DPPA4Q7L190 304 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 P3H4Q92791 437 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SMIM14Q96QK8 99 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCG4Q9H172 646 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CAPN8A6NHC0 703 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 H3BM21 787 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 OPA1O60313 960 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 APOC2P02655 101 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 C6P13671 934 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CES1P23141 567 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPN3P26045 913 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 UCNP55089 124 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SKOR1P84550 965 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ITKQ08881 620 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SGCGQ13326 291 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 NOMO1Q15155 1222 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ERAP2Q6P179 960 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 LIPIQ6XZB0 460 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 Q6ZSR6 202 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TADA1Q96BN2 335 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.08■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A1W2PQ67 120 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-210ENST00000559586 CFAP69A5D8W1 941 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-210ENST00000559586 TM7SF2O76062 418 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-210ENST00000559586 CPP00450 1065 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-210ENST00000559586 IGFALSP35858 605 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-210ENST00000559586 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-210ENST00000559586 TLE3Q04726 772 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-210ENST00000559586 AGERQ15109 404 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms