RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 PNCKQ6P2M8 343 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ZNF765Q7L2R6 523 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 SLCO6A1Q86UG4 719 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 DTD2Q96FN9 168 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 AGAP3Q96P47 875 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 RAD18Q9NS91 495 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TFR2Q9UP52 801 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 DOLKQ9UPQ8 538 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 WASF3Q9UPY6 502 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CHKBQ9Y259 395 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 NCOR2Q9Y618 2525 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA8CPA6NN73 597 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 A8MX80 341 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TNFP01375 233 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ANXA6P08133 673 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 HK3P52790 923 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PROX2Q3B8N5 592 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 NPNTQ6UXI9 565 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GKN2Q86XP6 184 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LMX1AQ8TE12 382 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TEKT5Q96M29 485 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 NSMCE3Q96MG7 304 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TOR4AQ9NXH8 423 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 DGKBQ9Y6T7 804 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD66B4E2M5 251 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 FFAR2O15552 330 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 SIGLEC6O43699 453 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GP1BAP07359 652 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PDHA1P08559 390 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 SRP54P61011 504 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 SKOR1P84550 965 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 SEMG2Q02383 582 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 NIPAL4Q0D2K0 466 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB17Q13105 803 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ZNF542PQ5EBM4 170 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LRRC66Q68CR7 880 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 DENND2CQ68D51 928 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TTC13Q8NBP0 860 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LPCAT1Q8NF37 534 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 KRT35Q92764 455 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LRRC45Q96CN5 670 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CDH19Q9H159 772 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GLOD4Q9HC38 313 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 OR1A2Q9Y585 309 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LMO7DNF2Z398 122 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CKMT1AP12532 417 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CTPS1P17812 591 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ACADVLP49748 655 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 HID1Q8IV36 788 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CNTD1Q8N815 330 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PNPLA1Q8N8W4 532 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 HTR3CQ8WXA8 447 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 UCKL1Q9NWZ5 548 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PKD2L2Q9NZM6 624 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 K7ESM1 405 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 LHCGRP22888 699 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PTPN3P26045 913 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ETV3P41162 512 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CDK18Q07002 472 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 H7C0C1 242 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 TRIM38O00635 465 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 MMP2P08253 660 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX3-202ENST00000539804 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms