RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	LMO7DN	F2Z398	122 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	LLGL1	Q15334	1064 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CDKN3	Q16667	212 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	DTD2	Q96FN9	168 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	ABCG4	Q9H172	646 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404		A0A0J9YYE9	177 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CPED1	A4D0V7	1026 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	YY2	O15391	372 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	TRBC1	P01850	177 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	TRIM23	P36406	574 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CD86	P42081	329 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CDKN2B	P42772	138 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	RPIA	P49247	311 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	ZBTB17	Q13105	803 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	NR0B2	Q15466	257 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	IFI44	Q8TCB0	444 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CEP41	Q9BYV8	373 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	AKAP13	Q12802	2813 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	FRY	Q5TBA9	3013 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	TMEM202	A6NGA9	273 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	IHH	Q14623	411 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	LRRC66	Q68CR7	880 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404		Q6ZVL8	140 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	GKN2	Q86XP6	184 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	MDM1	Q8TC05	714 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	PDXP	Q96GD0	296 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	AGAP3	Q96P47	875 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	OLFM3	Q96PB7	478 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404		A0A0U1RQS6	177 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CST8	O60676	142 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	GP1BA	P07359	652 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	NR2C2	P49116	596 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	PELI3	Q8N2H9	469 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	SMIM14	Q96QK8	99 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	BOC	Q9BWV1	1114 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	LGR4	Q9BXB1	951 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404		U3KQA8	63 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF30	P17039	623 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	FECH	P22830	423 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	CAMK2B	Q13554	666 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	CNTD1	Q8N815	330 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	GULP1	Q9UBP9	304 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	CD84	Q9UIB8	345 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	KRT37	O76014	449 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	SKOR1	P84550	965 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	GUSBP11	Q6P575	273 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	MAPK15	Q8TD08	544 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	P3H4	Q92791	437 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	FGF22	Q9HCT0	170 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	CAPN8	A6NHC0	703 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LRP4-205	ENST00000534404	TNFRSF10C	O14798	259 aa		32.99	■■■□□ 2.87

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