RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC4O95801 387 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ELFN1P0C7U0 828 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ACSL1P33121 698 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ELK3P41970 407 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 LIG3P49916 1009 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ACVR1Q04771 509 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 SLMAPQ14BN4 828 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 DENND2CQ68D51 928 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CASC4Q6P4E1 433 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC72A6NJI9 287 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PRR33A8MZF0 331 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PGAM1P18669 254 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CD6P30203 668 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 AGERQ15109 404 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 SKIDA1Q1XH10 827 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TSTD2Q5T7W7 516 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC25Q86WR0 208 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBED8Q8IZ13 594 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CDH19Q9H159 772 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TREX1Q9NSU2 369 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PKP3Q9Y446 797 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 A8MX80 341 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 BANF1O75531 89 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 USP1O94782 785 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM153BP0C7A2 387 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGEA4P43358 317 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 NUBP1P53384 320 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMG2Q02383 582 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT6Q14141 434 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM153CQ494X1 144 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 EMBQ6PCB8 327 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP2U1Q7Z449 544 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM124AQ86V42 546 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 COQ10AQ96MF6 247 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF778Q96MU6 729 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 KCTD5Q9NXV2 234 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A0U1RQS6 177 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 H7C0S8 307 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDH8O95206 1070 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA4FO95754 770 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 POLBP06746 335 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 C1SP09871 688 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 HADHAP40939 763 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 SPINT3P49223 89 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN5P54829 565 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM69Q86WT6 500 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 HORMAD1Q86X24 394 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ASB12Q8WXK4 309 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 NELL1Q92832 810 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 RAD18Q9NS91 495 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 CHMP2BQ9UQN3 213 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3EA0A087X179 549 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3LB9A6J9 549 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP20O60882 483 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3HP0C7X1 549 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 C6P13671 934 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 DCDC1P59894 354 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 STEAP4Q687X5 459 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.98■■□□□ 1.11
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