RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ADCY8P40145 1251 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 GDF10P55107 478 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TAS2R38P59533 333 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 RHOAP61586 193 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SEMG2Q02383 582 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ITKQ08881 620 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB17Q13105 803 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PTK6Q13882 451 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PRPSAP1Q14558 356 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CYTH1Q15438 398 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PARP6Q2NL67 630 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF567Q8N184 647 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC110Q8TBZ0 833 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 UBXN4Q92575 508 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CRELD1Q96HD1 420 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 AGAP3Q96P47 875 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PREBQ9HCU5 417 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 NT5MQ9NPB1 228 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 DYRK4Q9NR20 520 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.41□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PLXNA2O75051 1894 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PQU0 124 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PSMD3O43242 534 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ANXA9O76027 345 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PCDH8O95206 1070 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CD160O95971 181 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 THEGLP0DJG4 465 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ABCG1P45844 678 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CSNK1DP48730 415 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 RAD51Q06609 339 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 GPS1Q13098 491 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TEX35Q5T0J7 233 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PCGF5Q86SE9 256 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PLPP6Q8IY26 295 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CNTD1Q8N815 330 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CHST14Q8NCH0 376 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 BBOF1Q8ND07 529 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ARRDC3Q96B67 414 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ERP44Q9BS26 406 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CEP41Q9BYV8 373 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 GLOD4Q9HC38 313 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 FZD3Q9NPG1 666 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa11.4□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 E7EVH7 732 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM38O00635 465 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FFAR2O15552 330 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SIGLEC6O43699 453 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 POP4O95707 220 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 IGSF6O95976 241 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 GSRP00390 522 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PRNPP04156 253 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-DQB2P05538 268 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ETS1P14921 441 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 AKT2P31751 481 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SCNN1BP51168 640 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DRG2P55039 364 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 GEMP55040 296 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DAB2P98082 770 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ILKQ13418 452 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 GRM3Q14832 879 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PROX2Q3B8N5 592 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CARD16Q5EG05 197 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ARSIQ5FYB1 569 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SRLQ86TD4 932 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HORMAD1Q86X24 394 aa11.39□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms