RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRD-211ENST00000486161 IQCKQ8N0W5 287 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRD-211ENST00000486161 MED8Q96G25 268 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 LCA5Q86VQ0 697 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-211ENST00000486161 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.27□□□□□ -1.09
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