RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDH7Q9ULB5 785 aa3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CMAHPQ9Y471 501 aa3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYOM2P54296 1465 aa3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL6A3P12111 3177 aa3.9□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NAIPQ13075 1403 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR6C68A6NDL8 312 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTC36A6NLP5 189 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANXA2P2A6NMY6 339 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MCIDASD6RGH6 385 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRYO14603 147 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDC80O14777 642 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC30A4O14863 429 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLIC2O15247 247 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 B4GALT3O60512 393 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA7AO75326 666 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1RP00736 705 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SERPINC1P01008 464 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLKB1P03952 638 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MMP9P14780 707 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERCC2P18074 760 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CR2P20023 1033 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TACR2P21452 398 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STAT6P42226 847 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DIO1P49895 249 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KHKP50053 298 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF84P51523 738 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLCN3P51790 818 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BMXP51813 675 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 JAK3P52333 1124 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF132P52740 706 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAC3P60763 192 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 YPEL5P62699 121 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CXADRP78310 365 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HTD2P86397 168 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSG6Q00889 435 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTK6Q13882 451 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GEN1Q17RS7 908 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGSF11Q5DX21 431 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GBP6Q6ZN66 633 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 P3H2Q8IVL5 708 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KBTBD2Q8IY47 623 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYCP3Q8IZU3 236 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SFRP1Q8N474 314 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MB21D1Q8N884 522 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCAIQ8N9R8 606 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IPMKQ8NFU5 416 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OCC1Q8TAD7 63 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HDAC11Q96DB2 347 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MPHOSPH9Q99550 1183 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLA2G12BQ9BX93 195 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf21Q9H246 121 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIF9Q9HAQ2 790 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GLOD4Q9HC38 313 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STK26Q9P289 416 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FZD4Q9ULV1 537 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PXDNQ92626 1479 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPHP3Q7Z494 1330 aa3.89□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLTCL1P53675 1640 aa3.88□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HFM1A2PYH4 1435 aa3.88□□□□□ -1.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms