RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 SENP1Q9P0U3 644 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-204ENST00000402096 FAM50BQ9Y247 325 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-204ENST00000402096 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-204ENST00000402096 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-204ENST00000402096 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CLDN7O95471 211 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 BRAFP15056 766 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CREB1P16220 341 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TIE1P35590 1138 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ABCG1P45844 678 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MPP1Q00013 466 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 E2F5Q15329 346 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MTBPQ96DY7 904 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8RI6L899 631 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 K7EQS6 105 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ITGA2BP08514 1039 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 IL9P15248 144 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 HADHAP40939 763 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 UGP2Q16851 508 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 OR4L1Q8NH43 312 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 IL1BP01584 269 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 KRT4P19013 534 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 NFKBIAP25963 317 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 HMGCLP35914 325 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PFKPQ01813 784 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TFF2Q03403 129 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TTC7BQ86TV6 843 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 IL17CQ9P0M4 197 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SARDHQ9UL12 918 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TSPAN11A1L157 253 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 NPC1O15118 1278 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SPAG7O75391 227 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 EGFP01133 1207 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MC4RP32245 332 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 LIMK2P53671 638 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 C2orf27AQ580R0 203 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC66Q68CR7 880 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TMIEQ8NEW7 156 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SPOCK2Q92563 424 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SERAC1Q96JX3 654 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 LYSMD1Q96S90 227 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FAM129BQ96TA1 746 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 DKK3Q9UBP4 350 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CKAP5Q14008 2032 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 HMX2A2RU54 273 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 AHSGP02765 367 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TIMP2P16035 220 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF7Q14155 803 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CDKN3Q16667 212 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 EID2BQ96D98 161 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 VPS39Q96JC1 886 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 DYRK4Q9NR20 520 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms