RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SAC3D1A6NKF1 404 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ESRRGP62508 458 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PCSK7Q16549 785 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATS1Q496A3 300 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM171BQ6P995 826 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 S1PR4O95977 384 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 C7P10643 843 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN8P19075 237 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GRB14Q14449 540 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ADI1Q9BV57 179 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTR3BQ9P1U1 418 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FXYD1O00168 92 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 HAS3O00219 553 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX11BO96011 259 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 IL10P22301 178 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3BP2P78314 561 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PRAMEP78395 509 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MERTKQ12866 999 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6AP1Q15904 470 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF19Q2TAC6 998 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC36A3Q495N2 470 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL35Q6PF15 583 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR180Q86V85 440 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 C8orf4Q9NR00 106 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NR5A2O00482 541 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GNAO1P09471 354 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPN3P20807 821 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 BDNFP23560 247 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CCR1P32246 355 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SPRED1Q7Z699 444 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SPPL2CQ8IUH8 684 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 BBS5Q8N3I7 341 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FNDC8Q8TC99 324 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PTERQ96BW5 349 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ISOC1Q96CN7 298 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PHF12Q96QT6 1004 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 C9orf16Q9BUW7 83 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MROH6A6NGR9 719 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MATN4O95460 622 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 THP07101 528 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FASP25445 335 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PSEN2P49810 448 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 COQ5Q5HYK3 327 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR142Q7Z601 462 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MIER2Q8N344 545 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MYRFLQ96LU7 910 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PLGRKTQ9HBL7 147 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CMTM6Q9NX76 183 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH7Q9ULB5 785 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 AURKCQ9UQB9 309 aa22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK14O94921 469 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CCT8P50990 548 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXM1Q08050 763 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF786Q8N393 782 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PNPLA1Q8N8W4 532 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MIOSQ9NXC5 875 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FNIP2Q9P278 1114 aa22.14■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 WASH4PA8MWX3 477 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRG5Q8IZF4 528 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 FATE1Q969F0 183 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 GAD1Q99259 594 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ACBD6Q9BR61 282 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 EBF1Q9UH73 591 aa22.14■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ANGPT2O15123 496 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CD1DP15813 335 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC6A2P23975 617 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CTBSQ01459 385 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 KANK2Q63ZY3 851 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CD320Q9NPF0 282 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.13■■□□□ 1.13
HTATSF1-201ENST00000218364 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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