RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS38A1L453 326 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 HGSO14964 777 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 POLE2P56282 527 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 NKD1Q969G9 470 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LGR4Q9BXB1 951 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 EPN3Q9H201 632 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CHD5Q8TDI0 1954 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP69A5D8W1 941 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 J3KR12 359 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 RALGDSQ12967 914 aa27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 ACOX1Q15067 660 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SRLQ86TD4 932 aa27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 A8MX80 341 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 CCNB1P14635 433 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 NSFP46459 744 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 LRP4O75096 1905 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC13CQ8NB66 2214 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 WASH4PA8MWX3 477 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CCP110O43303 1012 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 LIFP15018 202 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CCR10P46092 362 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 RGRP47804 291 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LURAP1LQ8IV03 231 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GPBAR1Q8TDU6 330 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ART4Q93070 314 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PDFQ9HBH1 243 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF11O60813 436 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ECEL1O95672 775 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNB2P17787 502 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT1A3P35503 534 aa27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM72Q6ZMU5 477 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DPPA4Q7L190 304 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 AGBL5Q8NDL9 886 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TAAR2Q9P1P5 351 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD10Q9ULW2 581 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD62A6NC57 917 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PALMO75781 387 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF1P05230 155 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MPSTP25325 297 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GNPDA1P46926 289 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFBP7Q16270 282 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 NKAIN2Q5VXU1 208 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC30A9Q6PML9 568 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF438Q7Z4V0 828 aa27.4■■□□□ 1.98
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CAPNS1-217ENST00000629983 NRSN1Q8IZ57 195 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PELI3Q8N2H9 469 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A1Q9NY26 324 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 BSNQ9UPA5 3926 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6CA6NDK9 693 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6BA6NDN3 693 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP42A6NI28 874 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CALB1P05937 261 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6DP0CG33 693 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 AK4P27144 223 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CD1CP29017 333 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMK2P53671 638 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND2CQ68D51 928 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC24Q6P3W2 148 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 NRROSQ86YC3 692 aa27.39■■□□□ 1.98
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