RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RPS9P46781 194 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GRIK2Q13002 908 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NME3Q13232 169 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CTBP1Q13363 440 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ZNF460Q14592 562 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.726e-13■■□□□ 11.4
CS-202ENST00000542324 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SV2CQ496J9 727 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FAM72AQ5TYM5 149 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FAM72DQ6L9T8 149 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 LAYNQ6UX15 382 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RETREG3Q86VR2 466 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FAM72BQ86X60 149 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CLYBLQ8N0X4 340 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MIER2Q8N344 545 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TTC30BQ8N4P2 665 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CYGBQ8WWM9 190 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SLC35B4Q969S0 331 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HDAC10Q969S8 669 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NEURL2Q9BR09 285 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MAP10Q9P2G4 905 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 AURKCQ9UQB9 309 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NRCAMQ92823 1304 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TCRBV5S2A0A599 114 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 K7EPI3 171 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FXYD1O00168 92 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NR5A2O00482 541 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 VPS4BO75351 444 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 DNAJB5O75953 348 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FUCA1P04066 466 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CYP2C18P33260 490 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HTR7P34969 479 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ADRA1AP35348 466 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TAF6P49848 677 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CCR3P51677 355 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 BMXP51813 675 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TNK2Q07912 1038 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CSHL1Q14406 222 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TTLL4Q14679 1199 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NR1D2Q14995 579 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FGD3Q5JSP0 725 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 BROXQ5VW32 411 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SYPL2Q5VXT5 272 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SLC27A1Q6PCB7 646 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ALKAL1Q6UXT8 129 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 DDIASQ8IXT1 998 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SFRP1Q8N474 314 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TOP6BLQ8N6T0 577 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 APPL2Q8NEU8 664 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TANKQ92844 425 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ABHD8Q96I13 439 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 UBXN10Q96LJ8 280 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RDH12Q96NR8 316 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 IL12RB2Q99665 862 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GLOD4Q9HC38 313 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SELENONQ9NZV5 590 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ANAPC2Q9UJX6 822 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NEMP2A6NFY4 417 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 EI24O14681 340 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CLPXO76031 633 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 LDLRP01130 860 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 VTNP04004 478 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 LGALS2P05162 132 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TXNP10599 105 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SLC6A2P23975 617 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 LMO2P25791 158 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HALP42357 657 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 DAOAP59103 153 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms