RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 ELP6Q0PNE2 266 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 QPCTQ16769 361 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 SEC14L1Q92503 715 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 CASS4Q9NQ75 786 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 EBF1Q9UH73 591 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 CAPN8A6NHC0 703 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 NEMP1O14524 444 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 SLC7A4O43246 635 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF217O75362 1048 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 PRKCGP05129 697 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 ABL2P42684 1182 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 TPMTP51580 245 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 PLTPP55058 493 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 CSRP2Q16527 193 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 AGBL4Q5VU57 503 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 IFT81Q8WYA0 676 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 SCRN2Q96FV2 425 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 LOXL4Q96JB6 756 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SMIM20-201ENST00000506197 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 THADAQ6YHU6 1953 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 EPN2O95208 641 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ALPIP09923 528 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MLNP12872 115 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 OXTRP30559 389 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 GRIA1P42261 906 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 CUL1Q13616 776 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 FAM124AQ86V42 546 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ART4Q93070 314 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 SERPINB12Q96P63 405 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 HACD3Q9P035 362 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 PIRTP0C851 137 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 VIPR1P32241 457 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 HNF1BP35680 557 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NPY2RP49146 381 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGEF7Q14155 803 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NUMA1Q14980 2115 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 TRADDQ15628 312 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF534Q76KX8 674 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 PDIK1LQ8N165 341 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NETO1Q8TDF5 533 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 RTKNQ9BST9 563 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 GDF3Q9NR23 364 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 BFARQ9NZS9 450 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 AP1G1O43747 822 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 TPH1P17752 444 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MMP12P39900 470 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ADPRHP54922 357 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ARL4CP56559 192 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 SEPT6Q14141 434 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 HIF1AQ16665 826 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 PLK5Q496M5 336 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 DPPA4Q7L190 304 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 SPACA7Q96KW9 195 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 SMIM14Q96QK8 99 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms