RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497675.2

FAAP20-214, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 4,478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-214ENST00000497675 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 KLQ9UEF7 1012 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 USP1O94782 785 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 PLK1P53350 603 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 DNAJC3Q13217 504 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 SHHQ15465 462 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 SOX13Q9UN79 622 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 AURKCQ9UQB9 309 aa14.72□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 ADH1BP00325 375 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CYP51A1Q16850 503 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 SH3GL1Q99961 368 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 ABCG8Q9H221 673 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CCDC189A1A4V9 331 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 OR2AG2A6NM03 316 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 VIPR2P41587 438 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CACNG1Q06432 222 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 LAYNQ6UX15 382 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 FOXJ1Q92949 421 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FAAP20-214ENST00000497675 AIM2O14862 343 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 FSCN2O14926 492 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ALAS2P22557 587 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MARCKSL1P49006 195 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 FNIP2Q9P278 1114 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 THEGQ9P2T0 379 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 CD84Q9UIB8 345 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 KIAA0355O15063 1070 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RGS14O43566 566 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TNFP01375 233 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NTHL1P78549 312 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RTL10Q7L3V2 364 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NUS1Q96E22 293 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ALG9Q9H6U8 611 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 C5P01031 1676 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NBNO60934 754 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ALDH4A1P30038 563 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ABCG1P45844 678 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MED21Q13503 144 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 XKR4Q5GH76 650 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 FZD10Q9ULW2 581 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 KRT87PA6NCN2 255 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 COCHO43405 550 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 PFKFB4Q16877 469 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 AMZ2Q86W34 360 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ZIM3Q96PE6 472 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 H0YGN5 161 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 SCAMP1O15126 338 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NDUFS1P28331 727 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 NAA20P61599 178 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.7□□□□□ -0.06
FAAP20-214ENST00000497675 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms