RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478725.5

GUK1-223, Transcript of guanylate kinase 1, human

TSL 3

Gene GUK1, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GUK1-223	ENST00000478725	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	GBE1	Q04446	702 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ACOX1	Q15067	660 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	NR0B2	Q15466	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	CNGA3	Q16281	694 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	CDKN3	Q16667	212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	HID1	Q8IV36	788 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	LRRD1	A4D1F6	860 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	PSMD11	O00231	422 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ALPI	P09923	528 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	MX2	P20592	715 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	LHCGR	P22888	699 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	KEL	P23276	732 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	KDELR1	P24390	212 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	CCNC	P24863	283 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	TRIM23	P36406	574 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	RPIA	P49247	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ITK	Q08881	620 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	RTP5	Q14D33	572 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ELOC	Q15369	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	USP45	Q70EL2	814 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	GLMN	Q92990	594 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	HDAC11	Q96DB2	347 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	NUS1	Q96E22	293 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GUK1-223	ENST00000478725	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	CPED1	A4D0V7	1026 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	FZD6	O60353	706 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	CTSE	P14091	401 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	CCNB1	P14635	433 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	CES1	P23141	567 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	DSC2	Q02487	901 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	IHH	Q14623	411 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	ARL10	Q8N8L6	244 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	NAT6	Q93015	286 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GUK1-223	ENST00000478725	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22	2e-7	■□□□□ 10
GUK1-223	ENST00000478725	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms