RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474390.1

SOS1-208, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 4

Gene SOS1, Length 672 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SOS1-208	ENST00000474390	TUBB	P07437	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	GZMA	P12544	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	KLRC1	P26715	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	MARK3	P27448	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	HOXC8	P31273	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	PDE6C	P51160	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	LOXL3	P58215	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	MLC1	Q15049	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	KYAT1	Q16773	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390		Q9Y3F1	56 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOS1-208	ENST00000474390	SCN1A	P35498	2009 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390		A1L4Q6	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	HAS3	O00219	553 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	VNN1	O95497	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	IL33	O95760	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	POU2F2	P09086	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CLTA	P09496	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	MCF2	P10911	925 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CYP11B1	P15538	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	TMOD1	P28289	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	RGS2	P41220	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	KCNJ5	P48544	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	ACOT2	P49753	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CPT1A	P50416	773 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CLCN3	P51790	818 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	ZNF132	P52740	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	SOX8	P57073	446 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	FMO1	Q01740	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CDR2	Q01850	454 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOS1-208	ENST00000474390	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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