RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 PWWP2AQ96N64 755 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KIFC1Q9BW19 673 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR63Q9BZJ6 419 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SGK2Q9HBY8 427 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 EBF1Q9UH73 591 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SOX13Q9UN79 622 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PKP3Q9Y446 797 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF711Q9Y462 761 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC72A6NJI9 287 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMD11O00231 422 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PLK4O00444 970 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMTOR5O43504 91 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV3-19P01714 112 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKCGP05129 697 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 POLBP06746 335 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 GSTA2P09210 222 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PIRTP0C851 137 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TSHRP16473 764 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PGAM1P18669 254 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PAMP19021 973 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGCLP35914 325 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP12P39900 470 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 HADHAP40939 763 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ELK3P41970 407 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEA4P43358 317 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TPMTP51580 245 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MTM1Q13496 603 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKN3Q16667 212 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MSS51Q4VC12 460 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC66Q68CR7 880 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NEK5Q6P3R8 708 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PALM2Q8IXS6 379 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXL6Q8N531 539 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC25Q96NG3 672 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH19Q9H159 772 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PREBQ9HCU5 417 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RAD18Q9NS91 495 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SYBUQ9NX95 663 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC151A5D8V7 595 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MROH6A6NGR9 719 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MX80 341 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 K7ESF4 209 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 AXIN1O15169 862 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LDB2O43679 373 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SPAG6O75602 509 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 USP1O94782 785 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDH8O95206 1070 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CLDN7O95471 211 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ELFN1P0C7U0 828 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MYBL2P10244 700 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 STC1P52823 247 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPN5P54829 565 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ADPRHP54922 357 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CRADDP78560 199 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PTSQ03393 145 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RALGDSQ12967 914 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CNGA3Q16281 694 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms