RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434030.1

SEMA3B-205, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 1,011 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-205ENST00000434030 APC2O95996 2303 aa22.19■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 MT-CO3P00414 261 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ANXA6P08133 673 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 NFKBIAP25963 317 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 VIPR1P32241 457 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TRIM23P36406 574 aa22.19■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 CDKN3Q16667 212 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.19■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 IFI44Q8TCB0 444 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 SCRN2Q96FV2 425 aa22.19■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.19■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 FZD6O60353 706 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 RASGRP1O95267 797 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 PDHA1P08559 390 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CTSEP14091 401 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CCNB1P14635 433 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 MX2P20592 715 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 IHHQ14623 411 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 PNCKQ6P2M8 343 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 PELI3Q8N2H9 469 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TC2NQ8N9U0 490 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ATL2Q8NHH9 583 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 HDAC11Q96DB2 347 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 DTLQ9NZJ0 730 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 KLQ9UEF7 1012 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 AMACRQ9UHK6 382 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CPED1A4D0V7 1026 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 LRRD1A4D1F6 860 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TMEM202A6NGA9 273 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 LHCGRP22888 699 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CES1P23141 567 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 KIAA1024LP59773 190 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 DSC2Q02487 901 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TCEAL1Q15170 157 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ELOCQ15369 112 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 NR0B2Q15466 257 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 DENND2CQ68D51 928 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 KCTD16Q68DU8 428 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 GUSBP11Q6P575 273 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 PLD5Q8N7P1 536 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 NXPE2Q96DL1 559 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 LGR4Q9BXB1 951 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ABCG4Q9H172 646 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 RAXQ9Y2V3 346 aa22.17■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.17■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF487B1APH4 448 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TNFP01375 233 aa22.16■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 CTPS1P17812 591 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 RTP5Q14D33 572 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.16■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.16■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 KIF26BQ2KJY2 2108 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 PKD1L2Q7Z442 2459 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ZFHX4Q86UP3 3567 aa22.15■■□□□ 1.14
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