RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTAPQ13126 283 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTM1Q13496 603 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRADDQ15628 312 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SKIDA1Q1XH10 827 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CERCAMQ5T4B2 595 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF534Q76KX8 674 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PALM2Q8IXS6 379 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARRDC3Q96B67 414 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCRN2Q96FV2 425 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPACA7Q96KW9 195 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRGPRX1Q96LB2 322 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RANBP9Q96S59 729 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAD18Q9NS91 495 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYBUQ9NX95 663 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PKD2L2Q9NZM6 624 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B4GALT6Q9UBX8 382 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB21Q9UL25 225 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC151A5D8V7 595 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC72A6NJI9 287 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 E7ESA3 106 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0Y858 1186 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STX7O15400 261 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAMTOR5O43504 91 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPAN6O43657 245 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AP1G1O43747 822 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPAG6O75602 509 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDH8O95206 1070 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALPIP09923 528 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIRTP0C851 137 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIMP2P16035 220 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GABRG2P18507 467 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OXTRP30559 389 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HNF1BP35680 557 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MMP12P39900 470 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HADHAP40939 763 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELK3P41970 407 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGEA3P43357 314 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGEA4P43358 317 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FZD5Q13467 585 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IHHQ14623 411 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC73Q5JTD7 316 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DPPA4Q7L190 304 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AADATQ8N5Z0 425 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR14C36Q8NHC7 312 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PEX13Q92968 403 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFAP36Q96G28 342 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NSMCE3Q96MG7 304 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYSMD1Q96S90 227 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BTBD1Q9H0C5 482 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VPS37BQ9H9H4 285 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PREBQ9HCU5 417 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOX13Q9UN79 622 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPIL1Q9Y3C6 166 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANKRD36A6QL64 1941 aa10.28□□□□□ -0.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PSMD11O00231 422 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TP73O15350 636 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP1O94782 785 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRKCGP05129 697 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSTA2P09210 222 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSHRP16473 764 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ECHS1P30084 290 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STX2P32856 288 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DRD3P35462 400 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMGCLP35914 325 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPMTP51580 245 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PMS2P54278 862 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRAMEP78395 509 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRADDP78560 199 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAS6Q14393 721 aa10.27□□□□□ -0.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms