RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421404.1

RAD23BP1-201, Transcript of RAD23 homolog B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RAD23BP1, Length 1,227 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP1-201ENST00000421404 NOTCH4Q99466 2003 aa4.83□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.83□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 F5P12259 2224 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 A0A0U1RQJ8 604 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 SHISA7A6NL88 538 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 O00370 1275 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 CYB561D2O14569 222 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TEX28O15482 410 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TRAPPC3O43617 180 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 FOXS1O43638 330 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 KIF5CO60282 957 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 B3GAT3O94766 335 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ALDH2P05091 517 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 CYP1A2P05177 515 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 SETSIPP0DME0 302 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 MYBL1P10243 752 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TDGF1P13385 188 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 LAMP2P13473 410 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 CD58P19256 250 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TYMPP19971 482 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 MMP8P22894 467 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 KLRC2P26717 231 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 IL12RB1P42701 662 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GPD2P43304 727 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GABRB2P47870 512 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 LHX1P48742 406 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GALCP54803 685 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 STARD6P59095 220 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 NOMO3P69849 1222 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ADAM8P78325 824 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GPC5P78333 572 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 HHEXQ03014 270 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PTP4A2Q12974 167 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 DUSP8Q13202 625 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PGS1Q32NB8 556 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 Q6ZVL8 140 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 SLFN11Q7Z7L1 901 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 KIAA1328Q86T90 577 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PRR18Q8N4B5 295 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TMEM35BQ8NCS4 154 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TFAP2BQ92481 460 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 FGF14Q92915 247 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 MVB12AQ96EY5 273 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TNIP3Q96KP6 325 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 SENP8Q96LD8 212 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GNRHR2Q96P88 292 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 OR14A2Q96R54 314 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 MMS19Q96T76 1030 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GPHA2Q96T91 129 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ACBD6Q9BR61 282 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 EPC1Q9H2F5 836 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TDP1Q9NUW8 608 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TMEM140Q9NV12 185 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.82□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 A8MXQ7 604 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 SYN3O14994 580 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 THAP12O43422 761 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 AP1G1O43747 822 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TBC1D4O60343 1298 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 CALB1P05937 261 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ODC1P11926 461 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PRLRP16471 622 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 LMO2P25791 158 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 GZMKP49863 264 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 KRTAP10-2P60368 255 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TAF3Q5VWG9 929 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 WSCD1Q658N2 575 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 FAM171BQ6P995 826 aa4.81□□□□□ -1.64
RAD23BP1-201ENST00000421404 TSSK4Q6SA08 328 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms