RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.02□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 NXNL1Q96CM4 212 aa15.02□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 SGF29Q96ES7 293 aa15.02□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.02□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.02□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.02□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CDKN2DP55273 166 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CPXM2Q8N436 756 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 FIBINQ8TAL6 211 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 E2F7Q96AV8 911 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ASIC4Q96FT7 647 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 RANBP9Q96S59 729 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PIDD1Q9HB75 910 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 MKS1Q9NXB0 559 aa15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 TIMM44O43615 452 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 GLRA3O75311 464 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 S1PR4O95977 384 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 TYRP14679 529 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ZNF449Q6P9G9 518 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 TMEM207Q6UWW9 146 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 NAPRTQ6XQN6 538 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CLEC14AQ86T13 490 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ZNF366Q8N895 744 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ISL2Q96A47 359 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 SIRPGQ9P1W8 387 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 A0A0G2JND7 137 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 LINC01565O15544 149 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PAMP19021 973 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CD151P48509 253 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CSRP3P50461 194 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 UBE3AQ05086 875 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ZNF77Q15935 545 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 EML3Q32P44 896 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 MBLAC2Q68D91 279 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ZNF549Q6P9A3 640 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 KIRREL3Q8IZU9 778 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 TTC8Q8TAM2 541 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 IRF7Q92985 503 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 KCNK13Q9HB14 408 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 DCDC2Q9UHG0 476 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 FKBPLQ9UIM3 349 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 GBF1Q92538 1859 aa15□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 G3V2L1 256 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 UBOX5O94941 541 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 EPOP01588 193 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 SRCP12931 536 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ERVK-21P61565 698 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ITGA9Q13797 1035 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 GALNTL6Q49A17 601 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 C12orf40Q86WS4 652 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 C10orf82Q8WW14 230 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 NEMP2A6NFY4 417 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 OR1I1O60431 355 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 SIN3BO75182 1162 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 GEN1Q17RS7 908 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 AGR3Q8TD06 166 aa14.99□□□□□ -0.01
MKS1-202ENST00000393119 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms