RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ABCC6O95255 1503 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 FAM149AA5PLN7 773 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ADORA2AP29274 412 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 IFNGR2P38484 337 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ITGA7Q13683 1181 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PMF1Q6P1K2 205 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 C1orf127Q8N9H9 656 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NXNL1Q96CM4 212 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MYH10P35580 1976 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 AZIN1O14977 448 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SSNA1O43805 119 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SEPHS1P49903 392 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 C8orf4Q9NR00 106 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TOR4AQ9NXH8 423 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MLYCDO95822 493 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PPIL2Q13356 520 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 METTL21CQ5VZV1 264 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 RICTORQ6R327 1708 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NDUFAF6Q330K2 333 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 LGI2Q8N0V4 545 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 HDAC10Q969S8 669 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MTFR1LQ9H019 292 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 AREL1O15033 823 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GRK4P32298 578 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GAD2Q05329 585 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GRM3Q14832 879 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 HSDL1Q3SXM5 330 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 Q96MT0 163 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GIN1Q9NXP7 522 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 FFAR3O14843 346 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GPR42O15529 346 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 FYNP06241 537 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 DLG2Q15700 870 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CARTPTQ16568 116 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF516Q92618 1163 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PPP3R2Q96LZ3 170 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 A0A0J9YYE9 177 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 HPCAL1P37235 193 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PSEN1P49768 467 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CCNIQ14094 377 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NAT8LQ8N9F0 302 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PNPLA8Q9NP80 782 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF221Q9UK13 617 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 VWA7Q9Y334 891 aa18.71■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 H7C0S8 307 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 VNN1O95497 513 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 IDO1P14902 403 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF12P17014 697 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 KLRC2P26717 231 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 CCNFP41002 786 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 SEMA5AQ13591 1074 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 ATAD3BQ5T9A4 648 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 PLET1Q6UQ28 207 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 KRT77Q7Z794 578 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 SLC51AQ86UW1 340 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 SLITRK2Q9H156 845 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 C9JVG2 144 aa18.7■□□□□ 0.58
PRKCI-201ENST00000295797 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms