RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TMEM74Q96NL1 305 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 VWA7Q9Y334 891 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TET1Q8NFU7 2136 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TMEM114B3SHH9 223 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CDC7O00311 574 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 NCAM2O15394 837 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SMIM18P0DKX4 95 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CCNCP24863 283 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TBX4P57082 545 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 DUSP4Q13115 394 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 NADK2Q4G0N4 442 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 RABL3Q5HYI8 236 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 KDELC1Q6UW63 502 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 APBB2Q92870 758 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ISL2Q96A47 359 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ACBD6Q9BR61 282 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 H3BSA7 217 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 PIP5K1BO14986 540 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ADAM12O43184 909 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ANXA9O76027 345 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 BAIAP3O94812 1187 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 GFAPP14136 432 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 GKP32189 559 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 PRKCZQ05513 592 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ISCA2Q86U28 154 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 WBP2Q969T9 261 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 THEGQ9P2T0 379 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ACOT8O14734 319 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MRASO14807 208 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 BNIP3LO60238 219 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 S1PR4O95977 384 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V1B2P21281 511 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 OXTRP30559 389 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CHN2P52757 468 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 GEMP55040 296 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MBTPS1Q14703 1052 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 LINC00523Q86TU6 105 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 RMDN1Q96DB5 314 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MPP4Q96JB8 637 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 PKMYT1Q99640 499 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MAGEB16A2A368 324 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 AKAP10O43572 662 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 KATNA1O75449 491 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SUPT3HO75486 399 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TOMM70O94826 608 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 PRAMEF12O95522 483 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TFAP2AP05549 437 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 AKR1A1P14550 325 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 HCAR3P49019 387 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 NAB1Q13506 487 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 ADGRE1Q14246 886 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS1-201ENST00000262460 MYLK3Q32MK0 819 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms