RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 IMPDH2P12268 514 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PBX3P40426 434 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NAGLUP54802 743 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PFKPQ01813 784 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ELP6Q0PNE2 266 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TPGS2Q68CL5 300 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CASP12Q6UXS9 341 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KRT73Q86Y46 540 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FUKQ8N0W3 1084 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DAW1Q8N136 415 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PROX1Q92786 737 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LINGO1Q96FE5 620 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 XPR1Q9UBH6 696 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 AVILO75366 819 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ULK1O75385 1050 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6V1B1P15313 513 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ITGA2P17301 1181 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CAPZA2P47755 286 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PCYT1AP49585 367 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TFAP2BQ92481 460 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ITCHQ96J02 903 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB118Q96PH6 123 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IGFLR1Q9H665 355 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GVM2 712 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SPAM1P38567 509 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PLK1P53350 603 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 AP1S1P61966 158 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SPIDRQ14159 915 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ACAP2Q15057 778 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DOK6Q6PKX4 331 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF599Q96NL3 588 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 COPS8Q99627 209 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 COPG2Q9UBF2 871 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TCEA3O75764 348 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ELNP15502 786 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LIMK2P53671 638 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PSME3P61289 254 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TTC27Q6P3X3 843 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PSME2Q9UL46 239 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NFATC1O95644 943 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IL5RAQ01344 420 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TAC4Q86UU9 113 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF516Q92618 1163 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RNF145Q96MT1 663 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SEPHS2Q99611 448 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ASB3Q9Y575 518 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KCNE1P15382 129 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RFC2P35250 354 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PNLIPRP1P54315 467 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM11AP58511 58 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MAXP61244 160 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SEMA5AQ13591 1074 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GSTA3Q16772 222 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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