RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	MUSK	O15146	869 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CLCN5	P51795	746 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GSTA3	Q16772	222 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PIGG	Q5H8A4	983 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC10A3	P09131	477 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GATM	P50440	423 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	HK2	P52789	917 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PFKP	Q01813	784 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MED21	Q13503	144 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0D9SEW6	157 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	LDB2	O43679	373 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	S1PR4	O95977	384 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	KCNQ1	P51787	676 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PPP6C	O00743	305 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GPC4	O75487	556 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RBP1	P09455	135 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	VCL	P18206	1134 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB1	P25685	340 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB13	P59910	316 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF235	Q14590	738 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	UBD	O15205	165 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC7A4	O43246	635 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CA12	O43570	354 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	UQCRB	P14927	111 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ME2	P23368	584 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP4	Q13115	394 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ACAP2	Q15057	778 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GEN1	Q17RS7	908 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	AGK	Q53H12	422 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PTER	Q96BW5	349 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	EOMES	O95936	686 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PAX3	P23760	479 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ACLY	P53396	1101 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NME5	P56597	212 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SERINC3	Q13530	473 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.13	□□□□□ -0.31

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