RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PTPRR	Q15256	657 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TBATA	Q96M53	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078		B8ZZF3	427 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078		D6RAR5	112 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TOR1B	O14657	336 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	NOBOX	O60393	691 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	JMJD7	P0C870	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MMP12	P39900	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ETV5	P41161	510 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SCNN1B	P51168	640 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MAPK10	P53779	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	NFKB2	Q00653	900 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	RALGDS	Q12967	914 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ACOX1	Q15067	660 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LIPI	Q6XZB0	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	VASH2	Q86V25	355 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0U1RQS6	177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SLC28A2	O43868	658 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PSMA2	P25787	234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	NDST2	P52849	883 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CYP4F2	P78329	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	AMZ1	Q400G9	498 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	USP53	Q70EK8	1073 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	EXTL1	Q92935	676 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	USP7	Q93009	1102 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MED8	Q96G25	268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	WBP1	Q96G27	269 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SP110	Q9HB58	689 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ELFN1	P0C7U0	828 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GM2A	P17900	193 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ERCC2	P18074	760 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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