RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		A0A0U1RQS6	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ZNF185	O15231	689 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MMP20	O60882	483 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	OPHN1	O60890	802 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PCDH8	O95206	1070 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ALPI	P09923	528 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	VIPR1	P32241	457 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GRIA4	P48058	902 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GNG11	P61952	73 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GALNT3	Q14435	633 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CCNG2	Q16589	344 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CDKN3	Q16667	212 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ERAP2	Q6P179	960 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LIPI	Q6XZB0	460 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		H0Y8X5	98 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SLC31A1	O15431	190 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GCAT	O75600	419 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	METTL18	O95568	372 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ITGAV	P06756	1048 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	C1S	P09871	688 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CTPS1	P17812	591 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CA4	P22748	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ADRA1A	P35348	466 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	HNF1B	P35680	557 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LIG3	P49916	1009 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	WNT3A	P56704	352 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GRIK2	Q13002	908 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	IRF4	Q15306	451 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	USP45	Q70EL2	814 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PID1	Q7Z2X4	250 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CEP76	Q8TAP6	659 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SERAC1	Q96JX3	654 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MYOC	Q99972	504 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		A0A1B0GVT2	93 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP22-211	ENST00000584538	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP22-211	ENST00000584538	PSMD11	O00231	422 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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