RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 AKR1B10O60218 316 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 MMP20O60882 483 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TNFP01375 233 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 UGT2B4P06133 528 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 FAM87AP0C7U9 286 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CCDC172P0C7W6 258 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 KRT10P13645 584 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 MMP8P22894 467 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 PRKCIP41743 596 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ATP1A2P50993 1020 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 GRM3Q14832 879 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 NFATC4Q14934 902 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TGIF1Q15583 401 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TBR1Q16650 682 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ALG11Q2TAA5 492 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 MON1BQ7L1V2 547 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 BNIPLQ7Z465 357 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 DTX1Q86Y01 620 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CCNJLQ8IV13 435 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TC2NQ8N9U0 490 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 KYQ8NBH2 561 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 GPR156Q8NFN8 814 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 BTBD6Q96KE9 485 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 DNAJC7Q99615 494 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TRIM7Q9C029 511 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TRIM4Q9C037 500 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 THAP2Q9H0W7 228 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 GGT7Q9UJ14 662 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 MYO6Q9UM54 1294 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ITM2BQ9Y287 266 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 LAMA5O15230 3695 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CFAP69A5D8W1 941 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 STMND1H3BQB6 276 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TNFRSF10CO14798 259 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CCP110O43303 1012 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 BUB1O43683 1085 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 KDELR3O43731 214 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 PRAMEF10O60809 474 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 RAMP2O60895 175 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 IGSF6O95976 241 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 HGFP14210 728 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TIMP2P16035 220 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 KELP23276 732 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 GKP32189 559 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ADRA1BP35368 520 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ACVRL1P37023 503 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 OGDHQ02218 1023 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TLE1Q04724 770 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 MTM1Q13496 603 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 PEX6Q13608 980 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 ARHGEF7Q14155 803 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 INPP5AQ14642 412 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 IRF4Q15306 451 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-233ENST00000552688 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms