RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519686.6

VNN3-212, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-212ENST00000519686 HID1Q8IV36 788 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ZNF653Q96CK0 615 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TRIM11Q96F44 468 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 LRRC61Q9BV99 259 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 BOCQ9BWV1 1114 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ZWILCHQ9H900 591 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PDFQ9HBH1 243 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 THSD1Q9NS62 852 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 GULP1Q9UBP9 304 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SCINQ9Y6U3 715 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 LAMA5O15230 3695 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 KNTC1P50748 2209 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TSPAN11A1L157 253 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TCEA3O75764 348 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 RASGRP1O95267 797 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SERPINC1P01008 464 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ELFN1P0C7U0 828 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 MYBL1P10243 752 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TSHRP16473 764 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ERCC2P18074 760 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 MIPP30301 263 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 MMP12P39900 470 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 LSSP48449 732 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 CSNK1DP48730 415 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 RENBPP51606 427 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 HK3P52790 923 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 CXADRP78310 365 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PRR20EP86478 221 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PRR20CP86479 221 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PRR20DP86480 221 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PRR20BP86481 221 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PRR20AP86496 221 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SPIDRQ14159 915 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 NFATC4Q14934 902 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 AGERQ15109 404 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 CA9Q16790 459 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ISXQ2M1V0 245 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 GKN2Q86XP6 184 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 WDR48Q8TAF3 677 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 VOPP1Q96AW1 172 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 APOOQ9BUR5 198 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PRORYQ9H606 182 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 KLQ9UEF7 1012 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PADI4Q9UM07 663 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SATB2Q9UPW6 733 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 OR1A2Q9Y585 309 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.12□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 A0A1W2PQC6 194 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 H3BRJ5 948 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TNFP01375 233 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PRKCGP05129 697 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 GZMAP12544 262 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ARL4AP40617 200 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 HCAR3P49019 387 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ZNF165P49910 485 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SCNN1BP51168 640 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 UCNP55089 124 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TMPRSS3P57727 454 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TPM4P67936 248 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 TLE3Q04726 772 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 IL10RBQ08334 325 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 MTM1Q13496 603 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ZNF235Q14590 738 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 ALG11Q2TAA5 492 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 PERM1Q5SV97 790 aa9.11□□□□□ -0.95
VNN3-212ENST00000519686 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms