RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 DRD3P35462 400 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 KCNJ1P48048 391 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 RENBPP51606 427 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN6P56747 220 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 NXPH1P58417 271 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf54Q08AI8 447 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC3Q13217 504 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 CAMK2BQ13554 666 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 SHBQ15464 509 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 C4orf22Q6V702 233 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 EID2Q8N6I1 236 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 NETO2Q8NC67 525 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 SAP25Q8TEE9 199 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 FRS2Q8WU20 508 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 HTR3CQ8WXA8 447 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 KRT12Q99456 494 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 SARDHQ9UL12 918 aa11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
UBE2B-208ENST00000511807 SPEGQ15772 3267 aa11.46□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ZZEF1O43149 2961 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 J3KR12 359 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 YKT6O15498 198 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 KCNN4O15554 427 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 LATO43561 262 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ECEL1O95672 775 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CCNB1P14635 433 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 JUPP14923 745 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 DR1Q01658 176 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 DLG2Q15700 870 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 MARC1Q5VT66 337 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZVU0 165 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC89Q8N998 374 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SLCO2A1Q92959 643 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 USP29Q9HBJ7 922 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 DKK4Q9UBT3 224 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 AMACRQ9UHK6 382 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 VPS51Q9UID3 782 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CACNA1GO43497 2377 aa11.45□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 NUMA1Q14980 2115 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 C5orf60A6NFR6 353 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 FAM187AA6NFU0 413 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 C10orf142B7Z368 130 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SLC7A4O43246 635 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ATP9BO43861 1147 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SNAP91O60641 907 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 RFPL3O75679 317 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 ZMPSTE24O75844 475 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 IFNB1P01574 187 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 JCHAINP01591 159 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 HNF1BP35680 557 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 CNTN1Q12860 1018 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 BNIP3Q12983 259 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 STAT4Q14765 748 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R7Q15435 360 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TEX44Q53QW1 395 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 TTC27Q6P3X3 843 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 PID1Q7Z2X4 250 aa11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBE2B-208ENST00000511807 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms