RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MLYCD	O95822	493 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTSA	P10619	480 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CERS1	P27544	350 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EPHB2	P29323	1055 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GNAQ	P50148	359 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CLCN5	P51795	746 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMPRSS3	P57727	454 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OLR1	P78380	273 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NHLH1	Q02575	133 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GAD2	Q05329	585 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC18A2	Q05940	514 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RUNX2	Q13950	521 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MEA1	Q16626	185 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GSTA3	Q16772	222 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATG9B	Q674R7	924 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTI2	Q6NXR4	508 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TDRP	Q86YL5	185 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CADM3	Q8N126	398 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTC39C	Q8N584	583 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FRMD1	Q8N878	549 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC89	Q8N998	374 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SMARCE1	Q969G3	411 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRI	Q9BWK5	157 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	THSD1	Q9NS62	852 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VPS28	Q9UK41	221 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRRC37A3	O60309	1634 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SSH2	Q76I76	1423 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AK9	Q5TCS8	1911 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EVC2	Q86UK5	1308 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A096LPK6	155 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A1W2PPC1	479 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CBY3	A6NI87	242 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTC36	A6NLP5	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTGES3L	E9PB15	166 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HSPB6	O14558	160 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAM10	O14672	748 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LIAS	O43766	372 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATP2C2	O75185	946 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HEXA	P06865	529 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IRF1	P10914	325 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RARG	P13631	454 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTPN2	P17706	415 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNFSF8	P32971	234 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTK	P33981	857 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HOXD13	P35453	343 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HADHA	P40939	763 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CLDN2	P57739	230 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ID2	Q02363	134 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PKP1	Q13835	747 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCNG2	Q16589	344 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CES5A	Q6NT32	575 aa		3.29	□□□□□ -1.88

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