RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 KRT75O95678 551 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 DAOAP59103 153 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRKG2Q13237 762 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 REEP1Q9H902 201 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 KCTD5Q9NXV2 234 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 KCNU1A8MYU2 1149 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 AP2A1O95782 977 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PBX3P40426 434 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ACLYP53396 1101 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP1Q07960 439 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 FGD3Q5JSP0 725 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 OLFML2BQ68BL8 750 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 KLHL35Q6PF15 583 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TTYH3Q9C0H2 523 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ADAM30Q9UKF2 790 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZNF711Q9Y462 761 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TNFAIP8O95379 198 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GNA12Q03113 381 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ABRQ12979 859 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CRHR2Q13324 411 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 OR52K2Q8NGK3 314 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RAI2Q9Y5P3 530 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SERPINA6P08185 405 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZNF549Q6P9A3 640 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZNF446Q9NWS9 450 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ASF1AQ9Y294 204 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 C2CD4BA6NLJ0 364 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MATN3O15232 486 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 FAM20BO75063 409 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PAICSP22234 425 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CERCAMQ5T4B2 595 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 OTOP2Q7RTS6 562 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 DHRSXQ8N5I4 330 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GLMNQ92990 594 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CCL16O15467 120 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 COX4I1P13073 169 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 HGFP14210 728 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PKMP14618 531 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 AP1S1P61966 158 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GBE1Q04446 702 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CNSTQ6PJW8 725 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CYP2R1Q6VVX0 501 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CDYL2Q8N8U2 506 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SLC44A1Q8WWI5 657 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 COPG2Q9UBF2 871 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CCDC189A1A4V9 331 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SH3BGRLO75368 114 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PDE5AO76074 875 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 IDO1P14902 403 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MFSD5Q6N075 450 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 LRRC57Q8N9N7 239 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF4Q9NR80 690 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TK2O00142 265 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RGS5O15539 181 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CRATP43155 626 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CXCR3P49682 368 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 COPZ1P61923 177 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ALFQ53S48 1182 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 NAT16Q8N8M0 369 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 DBF4BQ8NFT6 615 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 COG5Q9UP83 839 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ASB3Q9Y575 518 aa17.08■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SPAM1P38567 509 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TPGS2Q68CL5 300 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CHST9Q7L1S5 443 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RNF148Q8N7C7 305 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 NELL1Q92832 810 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUOX1Q9NRD9 1551 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 H3BN98 237 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CACNG1Q06432 222 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 AP5B1Q2VPB7 878 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0408Q6ZU52 694 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZNF276Q8N554 614 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms