RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R3DO95685 299 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 CH25HO95992 272 aa4.37□□□□□ -1.71
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RABGGTB-210ENST00000485459 DAOP14920 347 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 CTPS1P17812 591 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 MYF6P23409 242 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 PEX5P50542 639 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 HDAC4P56524 1084 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 ERVFC1-1P60608 527 aa4.37□□□□□ -1.71
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RABGGTB-210ENST00000485459 KIF19Q2TAC6 998 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.37□□□□□ -1.712e-9■■■□□ 17
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RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa4.37□□□□□ -1.71
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RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD1Q15327 319 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.36□□□□□ -1.711e-9■■■■□ 25
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC18A3Q16572 532 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-210ENST00000485459 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 CUZD1Q86UP6 607 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-210ENST00000485459 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.36□□□□□ -1.71
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RABGGTB-210ENST00000485459 STAMQ92783 540 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 MTBPQ96DY7 904 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 ADGRG7Q96K78 797 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 MALT1Q9UDY8 824 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.36□□□□□ -1.711e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 KANK1Q14678 1352 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 KAT6BQ8WYB5 2073 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 B9A039 149 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 IGKV3-20P01619 116 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRM4P08173 479 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-210ENST00000485459 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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