RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 DLG3Q92796 817 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PTERQ96BW5 349 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PREBQ9HCU5 417 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CDH9Q9ULB4 789 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 AURKCQ9UQB9 309 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 BTRCQ9Y297 605 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 STRNO43815 780 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CLIC3O95833 236 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 GEN1Q17RS7 908 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 KIF19Q2TAC6 998 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 RANBP10Q6VN20 620 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 GPR152Q8TDT2 470 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 HDAC10Q969S8 669 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CCT7Q99832 543 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 OSER1Q9NX31 292 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 LAMA3Q16787 3333 aa14.14□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 A0A087X1B8 175 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 AKAP10O43572 662 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CNTN5O94779 1100 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 MT-ND1P03886 318 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 GPR15P49685 360 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ECT2LQ008S8 904 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 POU4F1Q01851 419 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 GRB7Q14451 532 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SQLEQ14534 574 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CHSY3Q70JA7 882 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SCN4AP35499 1836 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 E9PAM4 449 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SLC22A2O15244 555 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 NDST2P52849 883 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SLC5A3P53794 718 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 POTEHQ6S545 545 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 NUP93Q8N1F7 819 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TTC16Q8NEE8 873 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 HMCESQ96FZ2 354 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PTPN18Q99952 460 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 V9GYQ6 96 aa14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1W2PQH9 124 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 C8BP07358 591 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PAMP19021 973 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CCR1P32246 355 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 RHDQ02161 417 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 KDELC1Q6UW63 502 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SCD5Q86SK9 330 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 CROTQ9UKG9 612 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 UBXN8O00124 270 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 NRP2O60462 931 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 HK2P52789 917 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 SH3BP2P78314 561 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ALFQ53S48 1182 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 FAM47BQ8NA70 645 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.12□□□□□ -0.15
CNGA3-204ENST00000409937 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms