RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 S100ZQ8WXG8 99 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 GLOD4Q9HC38 313 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 NRP2O60462 931 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ITCHQ96J02 903 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A3O75751 556 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HDCP19113 662 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 DPYSQ14117 519 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA5Q16718 116 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D21Q8IYX1 336 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 UXS1Q8NBZ7 420 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PFKPQ01813 784 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 KLF10Q13118 480 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CUZD1Q86UP6 607 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 POMGNT2Q8NAT1 580 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ADRA1BP35368 520 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MON1AQ86VX9 555 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TEX44Q53QW1 395 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 RBFAQ8N0V3 343 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A2Q96QD8 506 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PANX1Q96RD7 426 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 VPS4AQ9UN37 437 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 IRF6O14896 467 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MAXP61244 160 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 COPZ1P61923 177 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD5Q16401 504 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 DENND1CQ8IV53 801 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00032P0C843 101 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 BNIP1Q12981 228 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NR1D2Q14995 579 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SCIMPQ6UWF3 145 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LINGO1Q96FE5 620 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 POLR1DQ9Y2S0 133 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB5O43674 189 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 XYLT1Q86Y38 959 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 OMA1Q96E52 524 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAG1P54619 331 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 IKBKEQ14164 716 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM40Q6P9F5 258 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MON1BQ7L1V2 547 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA6LQ8N4H0 392 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CPXM1Q96SM3 734 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MCM8Q9UJA3 840 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO10Q9UK96 956 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RFXANKO14593 260 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 KRT74Q7RTS7 529 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TM7SF2O76062 418 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 OR6A2O95222 327 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 EPORP19235 508 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 XKR6Q5GH73 641 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LRRN4Q8WUT4 740 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 OR52E6Q96RD3 313 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL31Q9H511 634 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TBL1XO60907 577 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms